Taille:
INSTITUT DE BIOLOGIE DE L'ÉCOLE NORMALE SUPÉRIEURE

Équipements

La plateforme génomique de l’Institut de Biologie de l’École normale supérieure (IBENS) regroupe l’ensemble des appareils nécessaire à la réalisation du séquençage à haut débit en génomique fonctionnelle. Ces machines sont accessibles à tous les laboratoires et entreprises privées qui le souhaitent soit en accès libre pour les machines les moins sensibles, soit sous la forme d’une collaboration ou après le suivi d’une formation pour les appareils plus complexes.

 

Réservation des appareils de la plateforme

La plateforme dispose d'un calendrier de réservation de façon à gerer l'accès aux appareils disponibles en libre service.

Pour y avoir accès vous pouvez cliquer ici ou passer par le menu de droite.

Analyses à haut débit

Séquenceur à Haut débit – NextSeq 500

  • Fabricant : Illumina
  • Installation : avril 2015
  • Séquençage de jusqu’à 400 millions de lectures en parallèle. Séquençage en mode haut ou moyen débit de lectures de 75 bases de long jusqu’à 2x 150 bases de long.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

qPCR à Haut Débit – Biomark HD system

  • Fabricant : Fluidigm
  • Installation : avril 2013
  • Système de PCR quantitative à Haut Débit par microfluidique.
  • Accès : contacter la plateforme de qPCR-HD par courrier électronique qpcr@biologie.ens.fr ou en allant sur leur site web.

Lecteur d’absorbance en plaque – SpectraMax Plus384

  • Fabricant : Molecular Devices
  • Installation : avril 2000
  • Système utilisé entre autre pour la quantification des produits de PCR amplifiés.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme.

Préparation des échantillons

Système de préparation de banques Apollo 324

  • Fabricant : Wafergen
  • Installation : janvier 2014
  • Préparation de banques d'ARN avec purification poly A, dépéletion ribosomique ou amplification du matériel génomique. Système flexible permettant de fabriquer de 2 à 48 banques en parallèle.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

Ultra-sonicateur – S220

  • Fabricant : Covaris
  • Installation : juin 2013
  • Sonication grâce à une onde ciblée des échantillons de façon homogène et sans réchauffement. Permet entre autre la fragmentation des banques pour le séquençage à haut débit et celui de l’ADN pour les expériences d’immuno-précipitations.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Système microfluidique de préparation des banques – Mondrian SP+

  • Fabricant : NuGEN
  • Installation : avril 2013
  • Préparation de banques d’ADN ou d’ARN de façon entièrement automatisée à l’aide d’un système de microfluidique.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

Automate pour la manipulation de liquide – BioRobot 8000

  • Fabricant : Qiagen
  • Installation : mars 2001
  • Robot pour la manipulation des liquides, le repiquage des colonies et les réarrangements des collections. Possède un bras munis de 8 cônes dont l’écartement est variable, de systèmes de détection de volumes et d’un lecteur de code barre intégré. L’automate permet de réaliser des extractions d’ADN et d’effectuer des dépôts sur gel d’agarose.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

Contrôle qualité

Électrophorèse capillaire – Bioanalyzer 2100

  • Fabricant : Agilent
  • Installation : janvier 2002
  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès : libre sur réservation pour les académiques après formation par le personnel de la plateforme. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Spectrophotomètre à UV – Nanodrop ND-1000

  • Fabricant : NanoDrop Technologies
  • Installation : mars 2006
  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès : libre pour les académiques.

Fluorimètre – QuBit 2.0

  • Fabricant : Life Technologies
  • Installation : mai 2012
  • Quantification des échantillons d’ADN, ARN et protéines en petite quantité.
  • Accès : libre pour les académiques.